Папка Workshop находится отдельно от папки rF2, туда оно скачивается изначально. Вообще установка контента в rF2, если не изменяет память, работает довольно диковато — сперва скачивается в Workshop, оттуда копируется в Packages, из Packages разворачивается в Installed. В плане удаления исходников — не помню, но тоже были какие то сложности, связанные с тем, что при следующем запуске оно снова пыталось перекачать удалённое.
Что касается «отписки при установке» — я в своё время «проэкспериментрировал» и предварительно всё «отключил». Но нет, rF2 первым делом обратно всё «подписал», после чего начал всё скачивать. Возможно нужно было немного поплясать с бубном, возможно с тех пор что-то изменилось — но проверять в ближайшую пару лет почему то совершенно не хочется : )