Обычно такое происходит в двух случаях:
1) проблемы с SSD\HDD
2) некий сторонний софт внес изменения в системные файлы. Иногда это лечится SFC /scannow. Иногда не лечится ничем, кроме переустановкой win. Это называется просто - "вирус сожрал винду".
Сейчас разбираюсь в вариантом 2) (не у себя ;)). Винда пожрана капитально - бекап не делается, обновления не ставятся, антивиря (любая) не устанавливается, восстановление системных файлов\обновление до последнего релиза "не удается завершить"(С)